
DNA CpG 甲基化检测
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描述
一:简介
DNA甲基化是一种表观遗传修饰,它在在甲基转移酶的催化下,DNA的CG两个核苷酸的胞嘧啶被选择性地添加甲基基团的化学修饰现象。DNA的甲基化会抑制基因的表达,DNA的甲基化对维持染色体的结构、X染色体的失活、基因印记和肿瘤的发生发展都起重要的作用。主要应用于基因转录调控机制的研究、很多疾病的诊断和治疗。
二:服务介绍
常用的检测方法:
1、MSP法
基因组DNA经亚硫酸钠修饰处理后,设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR扩增,通过电泳检测甲基化状态。
服务内容:
(1)基因组DNA的Bisulfite转化;
(2)DNA甲基化检测—基于MSP(Methylation Specific PCR)法。
我们提供:
(1)剩余的Bisulfite处理的基因组DNA;
(2)实验报告(包括MSP产物的电泳图片)。
2、BSP法:
基因组DNA经亚硫酸钠修饰处理后,设计BSP引物扩增目的片段,然后将PCR产物进行TA克隆,最后测序,判断CpG位点是否发生甲基化。
服务内容
(1)基因组DNA的Bisulfite转化;
(2)BSP(Bisulfite Sequencing PCR)法,克隆测序。
我们提供
(1)剩余的Bisulfite处理的基因组DNA;
(2)实验报告(包括BSP产物的电泳图片,测序的峰图)。
3、HRM法:
基因组DNA经亚硫酸钠修饰处理后,在非CpG岛位置设计一对针对经亚硫酸氢钠处理后DNA 链的引物,这对引物中间包含有意义的甲基化CpG岛,一旦这些CpG岛发生甲基化,胞嘧啶(C)不发生变化,而未甲基化的胞嘧啶(C)转变成胸腺嘧啶(T),样品中的 GC 含量发生了变化,最终被转化成了熔解曲线 Tm 值之间的差异。